Līgatnes upe, pateicoties straujajai ūdenstecei un dzidrajam ūdenim, ir lieliska dzīves telpa forelēm un alatām. Savulaik upē bija bagātīga foreļu populācija, bet alatas dzīvoja posmā no Anfabrikas slūžām līdz Ķempju dzirnavu aizsprostam. Pagājušā gadsimta beigu gados, nekontrolētas rīcības rezultātā, zivju resursi upes baseinā gandrīz pilnība tika iznīcināti. Tagad, pateicoties biedrības "Līgatnes upes saimnieki" un Līgatnes pašvaldības gādībai, tiek realizētu vairāki projekti, lai upi "atdzīvinātu", lai tā būtu tīkama makšķerniekiem, tūristiem un dabas vērotājiem.
Šogad upē, papildus alatām, ir ielaisti 5000 strauta foreļu mazuļu. Ir nodrošināta un mērķtiecīgi tiek pastiprināta zivju resursu aizsardzība piesaistot Valsts vides dienesta un GNP inspektorus, iesaistot pašvaldības policiju un vietējos entuziastus. Upes un zivju resursu aizsardzībā tiek izmantotas jaunākās tehnoloģijas, tai skaitā videonovērošana un citas.
Lejpus Anfarbrikas slūžām, dabas vērotāju ērtībām, ir izbūvēta "Zivju nārsta vērošanas taka" un visdrīzākajā laikā pār Anfabrikas slūžām plānots uzbūvēt funkcionālu zivju ceļu.