Pēc neatkarības atgūšanas Maklakovs kļuva par Nacionālās aizsardzības akadēmijas (NAA) Skaitļošanas centra vadošo inženieri programmētāju, vēlāk Ieroču veidu kaujas pielietošanas un Inženierzinātņu katedras pasniedzēju, Inženierzinātņu katedras vadītāju, NAA prorektoru mācību darbā, NAA rektoru, Gaisa spēku komandieri. 2006.gada 13.jūlijā tika iecelts NBS komandiera amatā.
Maklakovam piešķirta ģenerālmajora pakāpe
Nacionālo Bruņoto spēku (NBS) komandierim Jurim Maklakovam ceturtdien piešķirta ģenerālmajora pakāpe, pavēstīja NBS preses dienestā. Maklakovs ir absolvējis Kaļiņingradas kara aviācijas inženieru skolu, Žukovska vārdā nosauktā Gaisa spēku kara inženieru akadēmiju un ASV Armijas kara koledžu. Dienestu viņš ir uzsācis kā Radiotehnisko iekārtu apkalpes tehniķis, vēlāk Radiotehnisko iekārtu apkalpes grupas priekšnieks.
Uzmanību!
Pieprasītā sadaļa var saturēt erotiskus materiālus, kuru apskatīšana atļauta tikai pilngadību sasniegušām personām.